Santa Margherita, Cortona, Basilica minor in Cortona, Italië.

Santa Margherita is een rooms-katholieke basiliek in neogotische stijl net buiten Cortona, op de kruising van de Via delle Santucce en de Via Sant'Margherita, op een heuvel onder de Fortezza Medicea. Het huidige neogotische gebouw is het werk van Enrico Presenti en Mariano Falcini, met een gevel van Domenico Mirri, voltooid door Giuseppe Castellucci. Van de vroegere kerk resteren alleen het koor en het tweede en derde gewelf van het middenschip.

Na de dood van Margaretha van Cortona in 1297 werd op de plek van de oudere San Basilio een nieuwe kerk gebouwd, waarbij architect Giovanni Pisano betrokken was bij het vroege werk. Het gebouw werd in de loop der eeuwen meerdere keren herbouwd en verbouwd, en kreeg zijn huidige uiterlijk in de 19e eeuw.

De kerk is gewijd aan Margaretha van Cortona, een franciscaanse tertiaris die in 1297 stierf in een kamer achter de oude kerk, ongeveer waar nu het derde altaar links staat. Een houten kruisbeeld uit de 13e eeuw, afkomstig uit San Francesco in Cortona, zou het kruis zijn waarvoor zij bad. Haar lichaam rust in een zilveren schrijn uit 1774 op het hoofdaltaar.

De kerk staat op de kruising van de Via delle Santucce en de Via Sant Margherita, op de heuvel net onder de Medici-fort, zodat de toegang via de bovenstad omhoogloopt. Achter de kerk staan de klokkentoren uit 1650 en het franciscanenklooster. Het interieur wordt betreden via de door Giuseppe Castellucci voltooide façade.

De kerk werd in 1927 verheven tot basilica minor. Achter het gebouw staan een klokkentoren uit 1650 en een klooster van de franciscaner orde; de kerk ligt op een heuvel net onder de Fortezza Medicea, op de kruising van de Via delle Santucce en de Via Santa Margherita.